HKS以改装涡轮而知名，但以现今的引擎科技，根本不可能单靠优秀的机械设计和运作就可完成做功过程，甚至寸步难行。于是便出现了引擎管理系统的改装。引擎管理系统，基本上以控制几大分系统为目标，供油系统、点火系统等。而电脑的形式也多种多样，最基本的更换芯片式、外挂电脑式、直接替换式等。

　　高端型号F-CON V Pro，其中供油和点火可

　　以在32×32的MAP网格内进行调整。

　　低端一点便是F-CON S，MAP网格只有16×24。

　　HKS的引擎管理系统F-CON系列便属于外挂式的系统，但其功能相当强大，可以配合周边硬件升级而进行适当的修改。其工作原理是从原车的行驶电脑上获取各种资讯，例如进气量、进气压力、爆震讯号、排气内氧含量、节气门位置、曲轴位置、凸轮轴位置、燃油压力等等，再将这些数据搜集后经由自己内部的32位电脑(类似于单片机)进行处理后，将相应的控制信号传至各侍服机构，而完成整个搜集、控制、反馈过程(部分功能仍要依赖原装电脑，例如空调系统、动力转向)。但是，新买回来的F-CON电脑里内可以说是一片空白的，HKS只提供一套操作界面和简单的说明书，其他的一切，就要TUNER自行设定了，虽然可以对应的车型非常多(但不同车型需要购置不同的电脑线排，以对应原装车电脑)，但要求TUNER也要具有相当的电脑设定功力，而且调教所需时间也非常长。当然，如果在HKS的授权店家内，已经会有大部分对应日本车型的基础程式，将基础程式写入电脑后，再对相关附件的附件参数，例如空气流量计形式、节气门的电位计电压数值、气缸数、排气量、喷油咀喷射量、曲轴转速信号设定、凸轮轴转速型号设定等，然后再进行相关的实际行驶设定就可。

　　HKS F-CON系列电脑，目前主要分为两档，高级型号为F-CON V Pro，也是目前日系电脑中最强大的一款，它具备了32×32的MAP网格调整，而且几乎可以高精度地控制原装的所有供油、点火程序，目前最新的型号是3.2版本，而且有英文版供应及部分欧洲车型对应。而较低级别的则是F-CON S，具备了16×24的MAP网格调整能力，但控制功能不如F-CON V Pro般全面，两者对比，就有如DVD与VCD的区别。当然两者的价格的差别也是巨大的。